A Medicover Egészségpénztár legfőbb szerve a Küldöttközgyűlés.  A küldöttközgyűlésen a tagok jogait az Alapszabályban meghatározott eljárás szerint megválasztott Küldöttek gyakorolják, a pénztártagok tanácskozási joggal jogosultak részt venni a Küldöttgyűlés ülésein.

A Medicover Egészségpénztárban 8 területi körzet van. A 7 vidéki körzetet 1-1 fő küldött és 1-1 fő pótküldött, az 1 budapesti körzetet 5 fő küldött és 5 fő pótküldött képviseli.

A területi körzetek az alábbiak:

1. Győr központú területi körzethez tartozik: Győr-Moson-Sopron, Vas és Veszprém vármegye területe
2. Székesfehérvár központú területi körzethez tartozik: Komárom-Esztergom és Fejér vármegye területe
3. Paks központú területi körzethez tartozik: Tolna, Bács-Kiskun vármegye területe
4. Pécs központú területi körzethez tartozik: Baranya, Somogy és Zala vármegye területe
5. Nyíregyháza központú területi körzethez tartozik: Szabolcs-Szatmár-Bereg, Borsod-Abaúj-Zemplén és Nógrád vármegye területe
6. Debrecen központú területi körzethez tartozik: Hajdú-Bihar, Heves és Jász-Nagykun-Szolnok vármegye
7. Szeged központú területi körzethez tartozik: Csongrád és Békés vármegye területe
8. Budapest központú területi körzethez tartozik: Budapest és Pest vármegye területe, valamint a külföldi állampolgárok

A területi körzetekhez azon pénztártagok tartoznak, akiknek állandó lakóhelye az adott területi körzet közigazgatási területén van.

A Pénztár az info@medicoverep.hu  e-mail címen nyújt tájékoztatást a tagoknak arról, hogy mely küldött, illetve pótküldött képviseli őket.

A Pénztártagok kapcsolattartása az őket képviselő küldöttel írásban, a Medicover Egészségpénztár 1134 Budapest, Váci út 29-31. alatti címre küldött levélben lehetséges.